반갑습니다. (아주 알찬 블로그를 운영하시는 분이네요. ^^)
2002라면 아직 아래아한글이 아랍이나 히브리어 같은 complex script를 제대로 지원도 안 하던 시절입니다. 그렇기 때문에 그 시절에 맞춰 편법으로 만들어진 히브리어 텍스트는 MS 워드 같은 곳에서는 분명 제대로 표시되지 않을 것이고 이렇다할 해결책이 있을 것 같지는 않습니다.
2002를 안 쓴 지 오래 되어 잘은 모르지만, 텍스트 배열 순서 같은 걸 수작업으로 바꿔 줘야 될 겁니다.
요즘 아래아한글(2005부터)이나 MS 워드는 왼쪽에서 오른쪽으로 순서대로 쳐도 자동으로 히브리어가 오른쪽에서 왼쪽 방향으로 출력됩니다. 그러나 과거 아래아한글은 그렇지 않았어요. 그런 동작 방식의 차이가 깨지는 원인이 아닐까 생각하며, 그 옛날 방식대로 잘 보이게 입력된 히브리어를 나중 방식대로 다시 변환하는 유틸리티 같은 건 제가 아는 바가 없다는 뜻입니다.